Dieses Museum ist auch bekannt als Bawati Museum oder die Mumienhalle, es beherbergt Funde aus einer gewaltigen Mumiengrabanlage, die in Bahariya entdeckt wurde. Die griechisch-römischen Mumien wurden durch Zufall gefunden, als ein Esel im Jahr 1996 in der Wüste über ein Loch stolperte und in die Decke einer Grabkammer einbrach. Die Totenstadt darunter ist sehr weitläufig und man glaubt, dass dort etwa 10.000 Mumien begraben sind.

Viele von ihnen waren reich verziert, einige mit Blattgold überzogen, andere trugen bemalte Masken und Schmuck, einige waren in Tonsärgen begraben, und andere in Leinentücher gewickelt. Sie waren umgeben von Amuletten, Münzen und Weinkrügen, die sie für ihr Leben nach dem Tod benötigten.

Unter den zehn ausgestellten Mumien des Museums befinden sich vier der berühmten Goldenen Mumien, die die Verstorbenen sehr naturgetreu mit lockigem Haar und langen Augenwimpern darstellen. Die Ausgrabungen im Tal der Goldenen Mumien sind eingestellt worden, weil die Mumien Schaden nehmen und zerfallen, wenn sie aus der Erde geholt werden.